在加州海滩出生的小海龟萨米(比利·安格 配音)，跟其他「海龟仔」一样，需要深入海洋，踏上成长旅程。出世第一天，他就遇上了同是刚出生的美女海龟莎莉(伊莎贝拉·弗尔曼 配音)，一见钟情，却竟遇上意外令他们失散。萨米一方面要坚负「海龟仔」的成长使命，展开海洋之旅，某一方面，他对莎莉念念不忘，誓要寻回挚爱。萨米不畏艰辛，在老友记阿威的陪同下，克服重重难关，经历紧张刺激的冒险旅程，还结识了很多好友，如八爪鱼保罗、神神化化的怪猫毛神神、几度救他一世的海龟罗拉等。萨米不甘做一只平凡的小海龟，他想环游世界，大开眼界。期间，萨米发现人类竟然不停破坏地球的自然环境，当他感到失望之际，却在危难间得到人类的拯救。萨米走过千山万水，更在旅途中重遇莎莉，一起寻找传说中的水底秘密通道，然而在他们面前，却是更多的险阻，他们必须力敌3D食人鱼、击退海底大白鲨，到最后，他们能否克服所有难关，找到生命中最重要的东西？