由于现实生活太多不如意事，大雄与朋友也想离家出走，但是日本的土地不足，所有土地都已经有了地主，由于哆啦A梦因家里托付照顾仓鼠也决定离家出走，于是他们决定来一次史上最大规模的离家出走——搭乘时光机到7万年前的日本，打算在这片原始国土发挥小宇宙，建立梦想家园。恰巧一个来自远古时代的光明族少年古古儿，因为时空错乱来到现代日本。哆啦A梦他们得知光明族人被黑暗族侵略，决定拯救他们。途中，一个黏土人，自称土球指他是巨尊比的忠实部下对哆啦A梦及其他人利用连岩石也能破坏的冲击波进行攻击，最后被哆啦A梦的避敌斗篷把冲击波反弹，最终土球被破坏。此后，哆啦A梦把土球的一块碎片交给哆啦美拿到22世纪检查。哆啦美指土球由形状记忆陶瓷制造，里面深入了一种让每个分子也记得自己的排列方式，从而得到自我修复。当哆啦A梦与同伴们回到七万年前时，巨尊比重新抓到光明族的人后为他建造常暗宫殿。他们之后立即赶往常暗宫殿，此后哆啦A梦发现了巨尊比为二十三世纪的时空罪犯。最终，哆啦美率时空警察到达将他拘捕了。