名剑客千人斩拔刀斋（佐藤健饰）在百家争鸣的动荡幕府末期，以雷霆万钧的「飞天御剑流」称霸暗杀界，但决心不杀人的他却立下不杀之誓而从此隐然于世流浪各地。没想到时至明治11年，竟有一名自称拔刀斋的男子随意杀害路人，百姓们因此陷入恐慌。 继承神谷活心流道场的女孩神谷薫（武井咲饰），因鲁莽的挑战而坠入危险之中，危急之下被自称绯村剑心的神秘男子拯救。小薫留下他在道场修练，却意外发现他竟是传说中的「千人斩拔刀斋」，而假冒拔刀斋的那名恶人，原来是受雇黑心实业家武田观柳（香川照之饰）的疯狂杀手刃卫（吉川晃司饰）。 隐世已久的剑心，眼看和平之世遭受威胁，为了打击妄想征服世界的狂傲武田，他如何恢复以往拔刀斋的刚强，解救被邪恶势力挟持的女医师高荷惠（苍井优饰），又如何与警官斋藤一（江口洋介饰）联手拯救受到鸦片迫害的广大居民？一场炫目的刀光剑影，即将一发不可收拾……